Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFC5P40937 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFC5P40937 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFC5P40937 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC5P40937 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC5P40937 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC5P40937 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC5P40937 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC5P40937 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC5P40937 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC5P40937 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC5P40937 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC5P40937 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC5P40937 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC5P40937 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC5P40937 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC5P40937 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFC5P40937 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RFC5P40937 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC5P40937 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC5P40937 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC5P40937 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC5P40937 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC5P40937 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC5P40937 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC5P40937 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC5P40937 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC5P40937 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC5P40937 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC5P40937 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC5P40937 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC5P40937 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC5P40937 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC5P40937 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC5P40937 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC5P40937 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC5P40937 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFC5P40937 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC5P40937 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC5P40937 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC5P40937 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC5P40937 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC5P40937 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC5P40937 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC5P40937 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC5P40937 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC5P40937 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC5P40937 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC5P40937 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC5P40937 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFC5P40937 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC5P40937 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC5P40937 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC5P40937 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC5P40937 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC5P40937 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC5P40937 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC5P40937 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC5P40937 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC5P40937 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC5P40937 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC5P40937 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC5P40937 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC5P40937 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFC5P40937 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC5P40937 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC5P40937 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC5P40937 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC5P40937 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC5P40937 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC5P40937 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC5P40937 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC5P40937 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC5P40937 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC5P40937 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC5P40937 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC5P40937 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC5P40937 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC5P40937 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC5P40937 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFC5P40937 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC5P40937 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC5P40937 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC5P40937 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC5P40937 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC5P40937 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC5P40937 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC5P40937 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC5P40937 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC5P40937 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC5P40937 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC5P40937 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC5P40937 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC5P40937 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFC5P40937 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFC5P40937 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFC5P40937 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFC5P40937 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RFC5P40937 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFC5P40937 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms