Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH1P40692 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH1P40692 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH1P40692 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH1P40692 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH1P40692 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH1P40692 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH1P40692 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH1P40692 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MLH1P40692 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH1P40692 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH1P40692 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH1P40692 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH1P40692 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH1P40692 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH1P40692 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH1P40692 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH1P40692 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH1P40692 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH1P40692 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH1P40692 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH1P40692 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH1P40692 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MLH1P40692 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH1P40692 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH1P40692 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH1P40692 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH1P40692 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH1P40692 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH1P40692 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH1P40692 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH1P40692 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH1P40692 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH1P40692 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MLH1P40692 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH1P40692 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH1P40692 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH1P40692 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH1P40692 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH1P40692 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH1P40692 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH1P40692 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH1P40692 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH1P40692 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH1P40692 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MLH1P40692 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH1P40692 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH1P40692 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH1P40692 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH1P40692 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH1P40692 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH1P40692 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH1P40692 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH1P40692 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH1P40692 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH1P40692 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH1P40692 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH1P40692 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH1P40692 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH1P40692 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH1P40692 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH1P40692 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MLH1P40692 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH1P40692 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH1P40692 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH1P40692 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH1P40692 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH1P40692 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH1P40692 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH1P40692 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH1P40692 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH1P40692 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH1P40692 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH1P40692 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH1P40692 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH1P40692 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH1P40692 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH1P40692 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH1P40692 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH1P40692 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH1P40692 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH1P40692 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH1P40692 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MLH1P40692 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH1P40692 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH1P40692 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH1P40692 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH1P40692 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH1P40692 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH1P40692 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH1P40692 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH1P40692 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH1P40692 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH1P40692 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH1P40692 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH1P40692 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH1P40692 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH1P40692 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH1P40692 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MLH1P40692 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms