Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGCXP38435 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGCXP38435 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GGCXP38435 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGCXP38435 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GGCXP38435 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGCXP38435 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGCXP38435 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GGCXP38435 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GGCXP38435 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGCXP38435 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGCXP38435 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGCXP38435 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGCXP38435 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGCXP38435 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGCXP38435 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGCXP38435 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGCXP38435 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGCXP38435 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGCXP38435 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GGCXP38435 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGCXP38435 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGCXP38435 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GGCXP38435 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGCXP38435 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGCXP38435 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGCXP38435 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGCXP38435 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGCXP38435 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGCXP38435 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGCXP38435 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGCXP38435 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGCXP38435 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGCXP38435 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GGCXP38435 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGCXP38435 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGCXP38435 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGCXP38435 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGCXP38435 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGCXP38435 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGCXP38435 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGCXP38435 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGCXP38435 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGCXP38435 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGCXP38435 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGCXP38435 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GGCXP38435 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGCXP38435 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGCXP38435 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGCXP38435 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGCXP38435 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GGCXP38435 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGCXP38435 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGCXP38435 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGCXP38435 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGCXP38435 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGCXP38435 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGCXP38435 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGCXP38435 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGCXP38435 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGCXP38435 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGCXP38435 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGCXP38435 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GGCXP38435 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGCXP38435 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GGCXP38435 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGCXP38435 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGCXP38435 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GGCXP38435 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGCXP38435 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGCXP38435 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGCXP38435 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGCXP38435 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGCXP38435 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGCXP38435 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGCXP38435 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGCXP38435 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGCXP38435 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGCXP38435 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGCXP38435 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGCXP38435 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGCXP38435 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGCXP38435 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGCXP38435 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGCXP38435 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GGCXP38435 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGCXP38435 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGCXP38435 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GGCXP38435 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGCXP38435 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGCXP38435 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGCXP38435 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGCXP38435 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGCXP38435 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGCXP38435 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GGCXP38435 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGCXP38435 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGCXP38435 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGCXP38435 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GGCXP38435 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms