Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 TFB2YPL122C 1542 nt3.03□□□□□ -1.92
AVT5P38176 YMR317WYMR317W 3423 nt3.02□□□□□ -1.93
AVT5P38176 HUL5YGL141W 2733 nt3.02□□□□□ -1.93
AVT5P38176 NOG1YPL093W 1944 nt3.02□□□□□ -1.93
AVT5P38176 AAD3YCR107W 1092 nt3.02□□□□□ -1.93
AVT5P38176 LRS4YDR439W 1044 nt3.02□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YGR114CYGR114C 390 nt3.02□□□□□ -1.93
AVT5P38176 MPC3YGR243W 441 nt3.02□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YAP5YIR018W 738 nt3.02□□□□□ -1.93
AVT5P38176 ERP1YAR002C-A 660 nt3.02□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YLR334CYLR334C 381 nt3.02□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YBL065WYBL065W 345 nt3.02□□□□□ -1.93
AVT5P38176 RBL2YOR265W 321 nt3.02□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YPL088WYPL088W 1029 nt3.02□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt3.02□□□□□ -1.93
AVT5P38176 SUC2YIL162W 1599 nt3.02□□□□□ -1.93
AVT5P38176 FAS1YKL182W 6156 nt3.02□□□□□ -1.93
AVT5P38176 SYT1YPR095C 3681 nt3.01□□□□□ -1.93
AVT5P38176 LTV1YKL143W 1392 nt3.01□□□□□ -1.93
AVT5P38176 KRE2YDR483W 1329 nt3.01□□□□□ -1.93
AVT5P38176 snR9snR9 187 nt3.01□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YDR271CYDR271C 372 nt3.01□□□□□ -1.93
AVT5P38176 CGR1YGL029W 363 nt3.01□□□□□ -1.93
AVT5P38176 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt3.01□□□□□ -1.93
AVT5P38176 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt3.01□□□□□ -1.93
AVT5P38176 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt3.01□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YGR018CYGR018C 330 nt3.01□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt3.01□□□□□ -1.93
AVT5P38176 EMC2YJR088C 879 nt3.01□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YHC1YLR298C 696 nt3.01□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YBL010CYBL010C 843 nt3.01□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YNL109WYNL109W 546 nt3.01□□□□□ -1.93
AVT5P38176 CSM4YPL200W 471 nt3.01□□□□□ -1.93
AVT5P38176 snR24snR24 89 nt3.01□□□□□ -1.93
AVT5P38176 ADF1YCL058W-A 342 nt3.01□□□□□ -1.93
AVT5P38176 EBS1YDR206W 2655 nt3.01□□□□□ -1.93
AVT5P38176 CHA4YLR098C 1947 nt3.01□□□□□ -1.93
AVT5P38176 PIG2YIL045W 1617 nt3.01□□□□□ -1.93
AVT5P38176 MIP6YHR015W 1980 nt3□□□□□ -1.93
AVT5P38176 MSM1YGR171C 1728 nt3□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt3□□□□□ -1.93
AVT5P38176 THO1YER063W 657 nt3□□□□□ -1.93
AVT5P38176 SLX9YGR081C 633 nt3□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YIR040CYIR040C 333 nt3□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YJL007CYJL007C 315 nt3□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YJL114WYJL114W 681 nt3□□□□□ -1.93
AVT5P38176 PBA1YLR199C 831 nt3□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YLR257WYLR257W 966 nt3□□□□□ -1.93
AVT5P38176 UBX4YMR067C 1251 nt3□□□□□ -1.93
AVT5P38176 RIM11YMR139W 1113 nt3□□□□□ -1.93
AVT5P38176 AIM36YMR157C 768 nt3□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YNL122CYNL122C 348 nt3□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt3□□□□□ -1.93
AVT5P38176 PKH1YDR490C 2301 nt3□□□□□ -1.93
AVT5P38176 SIZ1YDR409W 2715 nt3□□□□□ -1.93
AVT5P38176 PPQ1YPL179W 1650 nt3□□□□□ -1.93
AVT5P38176 FRE4YNR060W 2160 nt3□□□□□ -1.93
AVT5P38176 ALG8YOR067C 1734 nt2.99□□□□□ -1.93
AVT5P38176 ESA1YOR244W 1338 nt2.99□□□□□ -1.93
AVT5P38176 PKP2YGL059W 1476 nt2.99□□□□□ -1.93
AVT5P38176 HDA2YDR295C 2025 nt2.99□□□□□ -1.93
AVT5P38176 KAP95YLR347C 2586 nt2.99□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt2.99□□□□□ -1.93
AVT5P38176 FRQ1YDR373W 573 nt2.99□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt2.99□□□□□ -1.93
AVT5P38176 CNN1YFR046C 1086 nt2.99□□□□□ -1.93
AVT5P38176 DPH1YIL103W 1278 nt2.99□□□□□ -1.93
AVT5P38176 VMA5YKL080W 1179 nt2.99□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YPT7YML001W 627 nt2.99□□□□□ -1.93
AVT5P38176 RLP7YNL002C 969 nt2.99□□□□□ -1.93
AVT5P38176 RHO5YNL180C 996 nt2.99□□□□□ -1.93
AVT5P38176 RRG8YPR116W 834 nt2.99□□□□□ -1.93
AVT5P38176 CUR1YPR158W 759 nt2.99□□□□□ -1.93
AVT5P38176 STP1YDR463W 1560 nt2.99□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YML096WYML096W 1578 nt2.99□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YJL049WYJL049W 1353 nt2.99□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt2.98□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YMR046CYMR046C 1323 nt2.98□□□□□ -1.93
AVT5P38176 ARO80YDR421W 2853 nt2.98□□□□□ -1.93
AVT5P38176 LCB5YLR260W 2064 nt2.98□□□□□ -1.93
AVT5P38176 RRP42YDL111C 798 nt2.98□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YDL163WYDL163W 303 nt2.98□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt2.98□□□□□ -1.93
AVT5P38176 RPS8BYER102W 603 nt2.98□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.98□□□□□ -1.93
AVT5P38176 DSE2YHR143W 978 nt2.98□□□□□ -1.93
AVT5P38176 SNX4YJL036W 1272 nt2.98□□□□□ -1.93
AVT5P38176 ILM1YJR118C 612 nt2.98□□□□□ -1.93
AVT5P38176 PHD1YKL043W 1101 nt2.98□□□□□ -1.93
AVT5P38176 TPK3YKL166C 1197 nt2.98□□□□□ -1.93
AVT5P38176 CMS1YLR003C 876 nt2.98□□□□□ -1.93
AVT5P38176 RPS28BYLR264W 204 nt2.98□□□□□ -1.93
AVT5P38176 RPS8AYBL072C 603 nt2.98□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YRO2YBR054W 1035 nt2.98□□□□□ -1.93
AVT5P38176 SQS1YNL224C 2304 nt2.98□□□□□ -1.93
AVT5P38176 ENA2YDR039C 3276 nt2.97□□□□□ -1.93
AVT5P38176 ENA1YDR040C 3276 nt2.97□□□□□ -1.93
AVT5P38176 TGL3YMR313C 1929 nt2.97□□□□□ -1.93
AVT5P38176 YDL180WYDL180W 1644 nt2.97□□□□□ -1.93
AVT5P38176 SRP1YNL189W 1629 nt2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.2 ms