Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCAP37840 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCAP37840 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCAP37840 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCAP37840 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNCAP37840 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNCAP37840 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNCAP37840 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNCAP37840 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCAP37840 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCAP37840 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCAP37840 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCAP37840 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCAP37840 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCAP37840 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCAP37840 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCAP37840 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCAP37840 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCAP37840 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCAP37840 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCAP37840 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCAP37840 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCAP37840 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCAP37840 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCAP37840 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCAP37840 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCAP37840 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCAP37840 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCAP37840 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCAP37840 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCAP37840 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNCAP37840 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCAP37840 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCAP37840 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCAP37840 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCAP37840 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCAP37840 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCAP37840 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCAP37840 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCAP37840 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCAP37840 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCAP37840 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCAP37840 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCAP37840 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCAP37840 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCAP37840 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCAP37840 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCAP37840 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCAP37840 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCAP37840 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCAP37840 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCAP37840 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCAP37840 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCAP37840 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNCAP37840 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCAP37840 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCAP37840 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCAP37840 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCAP37840 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCAP37840 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCAP37840 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCAP37840 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCAP37840 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCAP37840 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCAP37840 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCAP37840 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCAP37840 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCAP37840 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCAP37840 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCAP37840 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCAP37840 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCAP37840 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCAP37840 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCAP37840 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCAP37840 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCAP37840 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNCAP37840 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCAP37840 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCAP37840 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCAP37840 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCAP37840 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCAP37840 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCAP37840 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCAP37840 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCAP37840 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCAP37840 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCAP37840 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCAP37840 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCAP37840 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCAP37840 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCAP37840 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCAP37840 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCAP37840 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCAP37840 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCAP37840 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCAP37840 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCAP37840 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCAP37840 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCAP37840 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNCAP37840 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms