Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FDFT1P37268 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms