Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP62P37198 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP62P37198 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP62P37198 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP62P37198 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP62P37198 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP62P37198 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP62P37198 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP62P37198 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP62P37198 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP62P37198 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP62P37198 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP62P37198 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUP62P37198 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP62P37198 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP62P37198 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP62P37198 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP62P37198 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP62P37198 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP62P37198 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP62P37198 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP62P37198 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP62P37198 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP62P37198 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP62P37198 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP62P37198 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP62P37198 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP62P37198 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP62P37198 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP62P37198 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP62P37198 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NUP62P37198 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP62P37198 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP62P37198 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP62P37198 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP62P37198 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP62P37198 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP62P37198 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP62P37198 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP62P37198 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP62P37198 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP62P37198 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP62P37198 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP62P37198 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP62P37198 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP62P37198 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP62P37198 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP62P37198 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP62P37198 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP62P37198 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP62P37198 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP62P37198 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP62P37198 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP62P37198 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP62P37198 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP62P37198 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP62P37198 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP62P37198 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP62P37198 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP62P37198 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP62P37198 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP62P37198 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP62P37198 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP62P37198 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP62P37198 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP62P37198 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP62P37198 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP62P37198 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP62P37198 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP62P37198 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP62P37198 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP62P37198 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP62P37198 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP62P37198 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP62P37198 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP62P37198 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP62P37198 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP62P37198 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP62P37198 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP62P37198 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP62P37198 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP62P37198 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP62P37198 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP62P37198 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP62P37198 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP62P37198 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP62P37198 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP62P37198 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP62P37198 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP62P37198 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP62P37198 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP62P37198 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP62P37198 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP62P37198 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP62P37198 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP62P37198 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP62P37198 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP62P37198 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP62P37198 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP62P37198 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms