Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
POLR2IP36954 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
POLR2IP36954 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms