Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBRP36941 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBRP36941 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBRP36941 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBRP36941 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBRP36941 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBRP36941 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LTBRP36941 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBRP36941 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBRP36941 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBRP36941 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBRP36941 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBRP36941 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBRP36941 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBRP36941 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBRP36941 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LTBRP36941 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBRP36941 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBRP36941 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBRP36941 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBRP36941 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBRP36941 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBRP36941 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBRP36941 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBRP36941 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBRP36941 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBRP36941 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBRP36941 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LTBRP36941 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBRP36941 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBRP36941 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBRP36941 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBRP36941 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBRP36941 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBRP36941 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBRP36941 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBRP36941 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBRP36941 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBRP36941 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBRP36941 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBRP36941 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTBRP36941 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LTBRP36941 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTBRP36941 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBRP36941 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBRP36941 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LTBRP36941 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBRP36941 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBRP36941 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTBRP36941 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTBRP36941 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBRP36941 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBRP36941 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBRP36941 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBRP36941 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBRP36941 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBRP36941 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBRP36941 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBRP36941 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBRP36941 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBRP36941 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBRP36941 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBRP36941 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBRP36941 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBRP36941 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBRP36941 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBRP36941 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBRP36941 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBRP36941 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBRP36941 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBRP36941 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBRP36941 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBRP36941 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBRP36941 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBRP36941 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBRP36941 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBRP36941 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBRP36941 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBRP36941 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBRP36941 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBRP36941 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBRP36941 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBRP36941 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBRP36941 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBRP36941 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBRP36941 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBRP36941 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBRP36941 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBRP36941 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBRP36941 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBRP36941 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBRP36941 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBRP36941 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBRP36941 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBRP36941 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBRP36941 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBRP36941 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBRP36941 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBRP36941 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LTBRP36941 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms