Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COPB2P35606 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COPB2P35606 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPB2P35606 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPB2P35606 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPB2P35606 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPB2P35606 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPB2P35606 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPB2P35606 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPB2P35606 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPB2P35606 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPB2P35606 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPB2P35606 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPB2P35606 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPB2P35606 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPB2P35606 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COPB2P35606 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COPB2P35606 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPB2P35606 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPB2P35606 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPB2P35606 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPB2P35606 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPB2P35606 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPB2P35606 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPB2P35606 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPB2P35606 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPB2P35606 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPB2P35606 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPB2P35606 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPB2P35606 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPB2P35606 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPB2P35606 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPB2P35606 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPB2P35606 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPB2P35606 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPB2P35606 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPB2P35606 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPB2P35606 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPB2P35606 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPB2P35606 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPB2P35606 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPB2P35606 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPB2P35606 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPB2P35606 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COPB2P35606 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COPB2P35606 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPB2P35606 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPB2P35606 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPB2P35606 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPB2P35606 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPB2P35606 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COPB2P35606 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPB2P35606 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COPB2P35606 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPB2P35606 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPB2P35606 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPB2P35606 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPB2P35606 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPB2P35606 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPB2P35606 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPB2P35606 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPB2P35606 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPB2P35606 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPB2P35606 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPB2P35606 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPB2P35606 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB2P35606 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB2P35606 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB2P35606 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB2P35606 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB2P35606 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB2P35606 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB2P35606 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB2P35606 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB2P35606 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB2P35606 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB2P35606 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB2P35606 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB2P35606 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB2P35606 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB2P35606 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB2P35606 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB2P35606 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB2P35606 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB2P35606 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB2P35606 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB2P35606 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB2P35606 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB2P35606 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPB2P35606 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB2P35606 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB2P35606 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB2P35606 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB2P35606 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB2P35606 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB2P35606 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB2P35606 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB2P35606 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB2P35606 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COPB2P35606 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms