Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTNNA1P35221 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms