Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM5P33992 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM5P33992 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM5P33992 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM5P33992 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM5P33992 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM5P33992 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM5P33992 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM5P33992 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM5P33992 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM5P33992 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM5P33992 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM5P33992 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM5P33992 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM5P33992 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM5P33992 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM5P33992 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM5P33992 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MCM5P33992 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MCM5P33992 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MCM5P33992 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM5P33992 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM5P33992 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM5P33992 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM5P33992 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM5P33992 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM5P33992 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM5P33992 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM5P33992 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM5P33992 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM5P33992 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM5P33992 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM5P33992 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM5P33992 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM5P33992 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM5P33992 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM5P33992 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM5P33992 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM5P33992 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM5P33992 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM5P33992 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM5P33992 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM5P33992 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM5P33992 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM5P33992 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM5P33992 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM5P33992 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM5P33992 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM5P33992 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM5P33992 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM5P33992 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM5P33992 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM5P33992 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM5P33992 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM5P33992 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM5P33992 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM5P33992 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM5P33992 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM5P33992 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM5P33992 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM5P33992 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM5P33992 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM5P33992 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM5P33992 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM5P33992 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM5P33992 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM5P33992 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM5P33992 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM5P33992 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM5P33992 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM5P33992 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM5P33992 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM5P33992 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM5P33992 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM5P33992 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM5P33992 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM5P33992 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM5P33992 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM5P33992 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM5P33992 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM5P33992 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM5P33992 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM5P33992 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM5P33992 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM5P33992 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM5P33992 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM5P33992 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM5P33992 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM5P33992 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM5P33992 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM5P33992 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM5P33992 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM5P33992 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM5P33992 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM5P33992 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM5P33992 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM5P33992 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM5P33992 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM5P33992 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM5P33992 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms