Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CPS1P31327 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CPS1P31327 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CPS1P31327 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CPS1P31327 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CPS1P31327 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CPS1P31327 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CPS1P31327 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CPS1P31327 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CPS1P31327 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CPS1P31327 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CPS1P31327 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CPS1P31327 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CPS1P31327 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CPS1P31327 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CPS1P31327 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CPS1P31327 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CPS1P31327 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CPS1P31327 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CPS1P31327 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CPS1P31327 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CPS1P31327 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CPS1P31327 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CPS1P31327 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CPS1P31327 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CPS1P31327 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CPS1P31327 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPS1P31327 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPS1P31327 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPS1P31327 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPS1P31327 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPS1P31327 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPS1P31327 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPS1P31327 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPS1P31327 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPS1P31327 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPS1P31327 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPS1P31327 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPS1P31327 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPS1P31327 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPS1P31327 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPS1P31327 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPS1P31327 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPS1P31327 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CPS1P31327 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CPS1P31327 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CPS1P31327 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CPS1P31327 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CPS1P31327 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CPS1P31327 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CPS1P31327 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CPS1P31327 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CPS1P31327 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CPS1P31327 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CPS1P31327 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CPS1P31327 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CPS1P31327 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CPS1P31327 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
CPS1P31327 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CPS1P31327 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CPS1P31327 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CPS1P31327 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CPS1P31327 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CPS1P31327 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CPS1P31327 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CPS1P31327 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CPS1P31327 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CPS1P31327 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CPS1P31327 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CPS1P31327 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CPS1P31327 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CPS1P31327 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CPS1P31327 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CPS1P31327 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CPS1P31327 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CPS1P31327 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CPS1P31327 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CPS1P31327 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CPS1P31327 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CPS1P31327 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CPS1P31327 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CPS1P31327 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CPS1P31327 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CPS1P31327 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CPS1P31327 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CPS1P31327 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CPS1P31327 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CPS1P31327 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
CPS1P31327 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CPS1P31327 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CPS1P31327 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CPS1P31327 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CPS1P31327 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CPS1P31327 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CPS1P31327 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CPS1P31327 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CPS1P31327 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CPS1P31327 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CPS1P31327 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CPS1P31327 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms