Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CLIP1P30622 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLIP1P30622 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms