Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLA-FP30511 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms