Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIPP30301 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIPP30301 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIPP30301 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIPP30301 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MIPP30301 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPP30301 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPP30301 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPP30301 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPP30301 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPP30301 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPP30301 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPP30301 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPP30301 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPP30301 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPP30301 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPP30301 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPP30301 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPP30301 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPP30301 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPP30301 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MIPP30301 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MIPP30301 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPP30301 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPP30301 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPP30301 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPP30301 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPP30301 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPP30301 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPP30301 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPP30301 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPP30301 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPP30301 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPP30301 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPP30301 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPP30301 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPP30301 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPP30301 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPP30301 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPP30301 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MIPP30301 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIPP30301 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIPP30301 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIPP30301 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIPP30301 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIPP30301 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIPP30301 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIPP30301 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIPP30301 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIPP30301 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIPP30301 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MIPP30301 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIPP30301 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIPP30301 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIPP30301 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MIPP30301 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIPP30301 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIPP30301 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIPP30301 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIPP30301 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIPP30301 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MIPP30301 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MIPP30301 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MIPP30301 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MIPP30301 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MIPP30301 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MIPP30301 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MIPP30301 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MIPP30301 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MIPP30301 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MIPP30301 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MIPP30301 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MIPP30301 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MIPP30301 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MIPP30301 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MIPP30301 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MIPP30301 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MIPP30301 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MIPP30301 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MIPP30301 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MIPP30301 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MIPP30301 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MIPP30301 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MIPP30301 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MIPP30301 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MIPP30301 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MIPP30301 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MIPP30301 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MIPP30301 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MIPP30301 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MIPP30301 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MIPP30301 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MIPP30301 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MIPP30301 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MIPP30301 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MIPP30301 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MIPP30301 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MIPP30301 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MIPP30301 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MIPP30301 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms