Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC27P30260 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC27P30260 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC27P30260 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC27P30260 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC27P30260 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC27P30260 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC27P30260 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC27P30260 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC27P30260 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDC27P30260 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC27P30260 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC27P30260 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC27P30260 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC27P30260 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC27P30260 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC27P30260 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC27P30260 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC27P30260 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDC27P30260 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC27P30260 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC27P30260 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC27P30260 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC27P30260 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC27P30260 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC27P30260 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC27P30260 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC27P30260 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC27P30260 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC27P30260 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC27P30260 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC27P30260 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC27P30260 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC27P30260 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC27P30260 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC27P30260 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC27P30260 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDC27P30260 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC27P30260 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC27P30260 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC27P30260 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC27P30260 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC27P30260 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC27P30260 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC27P30260 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC27P30260 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC27P30260 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC27P30260 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC27P30260 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC27P30260 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDC27P30260 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDC27P30260 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC27P30260 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC27P30260 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC27P30260 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC27P30260 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC27P30260 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC27P30260 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC27P30260 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC27P30260 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC27P30260 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC27P30260 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDC27P30260 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC27P30260 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC27P30260 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC27P30260 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC27P30260 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC27P30260 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC27P30260 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC27P30260 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC27P30260 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC27P30260 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC27P30260 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC27P30260 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC27P30260 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC27P30260 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDC27P30260 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC27P30260 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC27P30260 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC27P30260 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC27P30260 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC27P30260 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC27P30260 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC27P30260 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC27P30260 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC27P30260 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC27P30260 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC27P30260 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC27P30260 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDC27P30260 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC27P30260 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC27P30260 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC27P30260 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC27P30260 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC27P30260 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC27P30260 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC27P30260 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC27P30260 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC27P30260 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDC27P30260 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms