Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCAP28676 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCAP28676 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCAP28676 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCAP28676 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCAP28676 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCAP28676 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GCAP28676 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GCAP28676 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GCAP28676 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GCAP28676 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GCAP28676 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GCAP28676 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GCAP28676 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCAP28676 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCAP28676 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCAP28676 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCAP28676 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCAP28676 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCAP28676 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCAP28676 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCAP28676 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCAP28676 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCAP28676 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GCAP28676 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCAP28676 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCAP28676 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCAP28676 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCAP28676 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCAP28676 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCAP28676 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCAP28676 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCAP28676 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCAP28676 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCAP28676 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCAP28676 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCAP28676 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCAP28676 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GCAP28676 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCAP28676 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCAP28676 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCAP28676 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCAP28676 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCAP28676 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCAP28676 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCAP28676 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCAP28676 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCAP28676 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCAP28676 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GCAP28676 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCAP28676 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GCAP28676 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCAP28676 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCAP28676 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GCAP28676 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GCAP28676 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GCAP28676 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCAP28676 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCAP28676 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCAP28676 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCAP28676 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCAP28676 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCAP28676 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCAP28676 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCAP28676 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCAP28676 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCAP28676 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCAP28676 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCAP28676 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GCAP28676 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCAP28676 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCAP28676 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCAP28676 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCAP28676 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GCAP28676 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCAP28676 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCAP28676 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCAP28676 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCAP28676 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCAP28676 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCAP28676 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GCAP28676 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCAP28676 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCAP28676 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCAP28676 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GCAP28676 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCAP28676 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCAP28676 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCAP28676 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCAP28676 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCAP28676 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCAP28676 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCAP28676 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCAP28676 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCAP28676 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCAP28676 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCAP28676 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GCAP28676 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCAP28676 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCAP28676 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms