Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CNTFRP26992 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms