Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMLP26374 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMLP26374 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMLP26374 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMLP26374 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMLP26374 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMLP26374 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMLP26374 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMLP26374 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHMLP26374 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMLP26374 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMLP26374 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMLP26374 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMLP26374 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMLP26374 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMLP26374 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMLP26374 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHMLP26374 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMLP26374 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMLP26374 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMLP26374 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHMLP26374 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMLP26374 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMLP26374 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMLP26374 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMLP26374 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMLP26374 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMLP26374 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMLP26374 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMLP26374 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMLP26374 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMLP26374 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMLP26374 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMLP26374 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHMLP26374 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMLP26374 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMLP26374 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMLP26374 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMLP26374 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMLP26374 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMLP26374 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMLP26374 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMLP26374 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMLP26374 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMLP26374 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHMLP26374 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMLP26374 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMLP26374 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMLP26374 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMLP26374 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMLP26374 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHMLP26374 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMLP26374 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMLP26374 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMLP26374 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMLP26374 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMLP26374 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMLP26374 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMLP26374 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMLP26374 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMLP26374 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMLP26374 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMLP26374 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHMLP26374 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMLP26374 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMLP26374 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMLP26374 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMLP26374 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMLP26374 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMLP26374 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMLP26374 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMLP26374 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMLP26374 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMLP26374 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMLP26374 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMLP26374 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHMLP26374 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMLP26374 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMLP26374 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMLP26374 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMLP26374 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMLP26374 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMLP26374 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHMLP26374 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CHMLP26374 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMLP26374 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMLP26374 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMLP26374 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMLP26374 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMLP26374 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMLP26374 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMLP26374 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMLP26374 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMLP26374 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMLP26374 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMLP26374 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMLP26374 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMLP26374 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMLP26374 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHMLP26374 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms