Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFKBIAP25963 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms