Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2AP24928 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLR2AP24928 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2AP24928 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms