Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
VAMP1P23763 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms