Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PTPRGP23470 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRGP23470 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
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