Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPRDP23468 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
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