Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTPRBP23467 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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