Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMNB1P20700 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMNB1P20700 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms