Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNNI1P19237 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNNI1P19237 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms