Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTPRAP18433 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
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PTPRAP18433 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
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PTPRAP18433 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
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PTPRAP18433 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
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PTPRAP18433 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
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PTPRAP18433 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRAP18433 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
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