Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR1P18146 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR1P18146 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR1P18146 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EGR1P18146 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR1P18146 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR1P18146 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR1P18146 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR1P18146 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR1P18146 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR1P18146 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR1P18146 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR1P18146 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR1P18146 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR1P18146 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR1P18146 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR1P18146 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR1P18146 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR1P18146 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR1P18146 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR1P18146 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EGR1P18146 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR1P18146 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR1P18146 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR1P18146 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR1P18146 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR1P18146 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR1P18146 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR1P18146 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR1P18146 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR1P18146 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR1P18146 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR1P18146 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR1P18146 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR1P18146 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EGR1P18146 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR1P18146 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR1P18146 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR1P18146 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR1P18146 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR1P18146 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR1P18146 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR1P18146 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR1P18146 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR1P18146 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR1P18146 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR1P18146 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR1P18146 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR1P18146 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR1P18146 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR1P18146 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR1P18146 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR1P18146 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR1P18146 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR1P18146 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR1P18146 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR1P18146 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR1P18146 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR1P18146 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR1P18146 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EGR1P18146 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR1P18146 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR1P18146 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR1P18146 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR1P18146 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR1P18146 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR1P18146 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR1P18146 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR1P18146 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR1P18146 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR1P18146 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR1P18146 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR1P18146 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR1P18146 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR1P18146 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR1P18146 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR1P18146 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR1P18146 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR1P18146 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR1P18146 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR1P18146 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR1P18146 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EGR1P18146 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR1P18146 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR1P18146 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR1P18146 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR1P18146 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR1P18146 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR1P18146 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR1P18146 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR1P18146 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR1P18146 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR1P18146 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR1P18146 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR1P18146 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR1P18146 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR1P18146 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR1P18146 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR1P18146 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
EGR1P18146 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms