Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARF4P18085 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARF4P18085 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARF4P18085 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARF4P18085 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARF4P18085 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARF4P18085 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARF4P18085 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARF4P18085 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARF4P18085 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARF4P18085 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARF4P18085 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARF4P18085 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARF4P18085 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARF4P18085 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARF4P18085 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARF4P18085 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARF4P18085 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARF4P18085 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARF4P18085 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARF4P18085 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARF4P18085 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARF4P18085 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARF4P18085 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARF4P18085 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ARF4P18085 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARF4P18085 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ARF4P18085 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARF4P18085 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ARF4P18085 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARF4P18085 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARF4P18085 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARF4P18085 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF4P18085 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF4P18085 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF4P18085 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF4P18085 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF4P18085 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF4P18085 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF4P18085 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF4P18085 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF4P18085 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF4P18085 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF4P18085 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF4P18085 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF4P18085 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF4P18085 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF4P18085 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARF4P18085 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARF4P18085 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARF4P18085 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARF4P18085 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARF4P18085 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARF4P18085 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARF4P18085 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARF4P18085 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARF4P18085 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARF4P18085 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARF4P18085 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARF4P18085 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARF4P18085 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARF4P18085 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARF4P18085 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF4P18085 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF4P18085 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF4P18085 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF4P18085 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF4P18085 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF4P18085 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF4P18085 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF4P18085 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF4P18085 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF4P18085 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF4P18085 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARF4P18085 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARF4P18085 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARF4P18085 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARF4P18085 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARF4P18085 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARF4P18085 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARF4P18085 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARF4P18085 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARF4P18085 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARF4P18085 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARF4P18085 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARF4P18085 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARF4P18085 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARF4P18085 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARF4P18085 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARF4P18085 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARF4P18085 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARF4P18085 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARF4P18085 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARF4P18085 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARF4P18085 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARF4P18085 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARF4P18085 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARF4P18085 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARF4P18085 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARF4P18085 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms