Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDGFRAP16234 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDGFRAP16234 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms