Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRAFP15056 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRAFP15056 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRAFP15056 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BRAFP15056 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRAFP15056 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRAFP15056 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRAFP15056 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRAFP15056 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRAFP15056 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRAFP15056 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRAFP15056 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRAFP15056 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRAFP15056 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRAFP15056 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRAFP15056 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRAFP15056 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRAFP15056 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRAFP15056 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRAFP15056 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRAFP15056 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRAFP15056 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRAFP15056 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRAFP15056 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BRAFP15056 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRAFP15056 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRAFP15056 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRAFP15056 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRAFP15056 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRAFP15056 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRAFP15056 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRAFP15056 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BRAFP15056 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRAFP15056 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BRAFP15056 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
BRAFP15056 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BRAFP15056 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRAFP15056 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRAFP15056 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRAFP15056 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRAFP15056 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRAFP15056 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BRAFP15056 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRAFP15056 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRAFP15056 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRAFP15056 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRAFP15056 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BRAFP15056 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRAFP15056 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRAFP15056 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRAFP15056 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRAFP15056 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BRAFP15056 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRAFP15056 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRAFP15056 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRAFP15056 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRAFP15056 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRAFP15056 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRAFP15056 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BRAFP15056 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRAFP15056 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRAFP15056 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRAFP15056 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRAFP15056 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRAFP15056 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRAFP15056 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRAFP15056 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRAFP15056 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRAFP15056 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRAFP15056 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRAFP15056 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRAFP15056 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRAFP15056 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRAFP15056 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRAFP15056 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRAFP15056 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRAFP15056 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRAFP15056 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRAFP15056 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BRAFP15056 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRAFP15056 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BRAFP15056 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRAFP15056 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRAFP15056 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRAFP15056 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRAFP15056 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRAFP15056 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRAFP15056 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRAFP15056 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRAFP15056 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRAFP15056 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRAFP15056 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRAFP15056 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRAFP15056 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BRAFP15056 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRAFP15056 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRAFP15056 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRAFP15056 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRAFP15056 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BRAFP15056 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms