Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXB1P14653 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXB1P14653 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms