Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIM27P14373 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM27P14373 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms