Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA4P13612 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGA4P13612 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms