Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT3P12035 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT3P12035 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT3P12035 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT3P12035 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT3P12035 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT3P12035 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT3P12035 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT3P12035 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT3P12035 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT3P12035 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT3P12035 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT3P12035 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT3P12035 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT3P12035 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT3P12035 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT3P12035 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT3P12035 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT3P12035 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT3P12035 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT3P12035 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT3P12035 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT3P12035 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT3P12035 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT3P12035 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT3P12035 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT3P12035 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT3P12035 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT3P12035 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT3P12035 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT3P12035 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT3P12035 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT3P12035 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT3P12035 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT3P12035 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT3P12035 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT3P12035 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT3P12035 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT3P12035 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT3P12035 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT3P12035 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT3P12035 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT3P12035 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT3P12035 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT3P12035 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT3P12035 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT3P12035 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT3P12035 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT3P12035 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT3P12035 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT3P12035 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT3P12035 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT3P12035 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT3P12035 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT3P12035 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT3P12035 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT3P12035 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT3P12035 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT3P12035 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT3P12035 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT3P12035 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT3P12035 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT3P12035 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT3P12035 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT3P12035 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT3P12035 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT3P12035 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT3P12035 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT3P12035 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT3P12035 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT3P12035 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT3P12035 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT3P12035 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT3P12035 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT3P12035 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT3P12035 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT3P12035 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT3P12035 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT3P12035 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT3P12035 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT3P12035 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT3P12035 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT3P12035 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT3P12035 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT3P12035 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT3P12035 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT3P12035 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT3P12035 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT3P12035 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT3P12035 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT3P12035 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT3P12035 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT3P12035 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT3P12035 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT3P12035 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT3P12035 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT3P12035 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT3P12035 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT3P12035 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT3P12035 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms