Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBP3P10745 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBP3P10745 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBP3P10745 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBP3P10745 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBP3P10745 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBP3P10745 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBP3P10745 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBP3P10745 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBP3P10745 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBP3P10745 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBP3P10745 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBP3P10745 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RBP3P10745 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RBP3P10745 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RBP3P10745 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RBP3P10745 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RBP3P10745 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
RBP3P10745 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RBP3P10745 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RBP3P10745 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RBP3P10745 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RBP3P10745 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RBP3P10745 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RBP3P10745 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBP3P10745 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBP3P10745 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBP3P10745 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBP3P10745 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RBP3P10745 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBP3P10745 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBP3P10745 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBP3P10745 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBP3P10745 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBP3P10745 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBP3P10745 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBP3P10745 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RBP3P10745 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBP3P10745 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBP3P10745 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBP3P10745 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBP3P10745 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBP3P10745 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBP3P10745 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBP3P10745 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBP3P10745 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBP3P10745 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBP3P10745 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBP3P10745 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBP3P10745 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RBP3P10745 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBP3P10745 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBP3P10745 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBP3P10745 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBP3P10745 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBP3P10745 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBP3P10745 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBP3P10745 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBP3P10745 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBP3P10745 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBP3P10745 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBP3P10745 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBP3P10745 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RBP3P10745 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBP3P10745 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBP3P10745 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBP3P10745 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBP3P10745 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBP3P10745 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBP3P10745 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBP3P10745 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBP3P10745 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBP3P10745 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBP3P10745 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBP3P10745 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBP3P10745 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBP3P10745 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBP3P10745 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBP3P10745 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RBP3P10745 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBP3P10745 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBP3P10745 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBP3P10745 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBP3P10745 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBP3P10745 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBP3P10745 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RBP3P10745 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBP3P10745 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBP3P10745 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBP3P10745 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBP3P10745 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBP3P10745 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBP3P10745 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBP3P10745 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBP3P10745 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBP3P10745 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBP3P10745 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBP3P10745 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBP3P10745 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBP3P10745 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms