Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HKR1P10072 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HKR1P10072 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HKR1P10072 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HKR1P10072 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HKR1P10072 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HKR1P10072 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HKR1P10072 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HKR1P10072 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HKR1P10072 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HKR1P10072 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HKR1P10072 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HKR1P10072 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HKR1P10072 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HKR1P10072 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HKR1P10072 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HKR1P10072 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HKR1P10072 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HKR1P10072 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HKR1P10072 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HKR1P10072 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HKR1P10072 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HKR1P10072 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HKR1P10072 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HKR1P10072 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HKR1P10072 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HKR1P10072 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HKR1P10072 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HKR1P10072 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HKR1P10072 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HKR1P10072 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HKR1P10072 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HKR1P10072 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HKR1P10072 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HKR1P10072 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HKR1P10072 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HKR1P10072 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HKR1P10072 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HKR1P10072 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HKR1P10072 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HKR1P10072 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HKR1P10072 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HKR1P10072 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HKR1P10072 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HKR1P10072 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HKR1P10072 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HKR1P10072 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HKR1P10072 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HKR1P10072 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HKR1P10072 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HKR1P10072 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HKR1P10072 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HKR1P10072 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HKR1P10072 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HKR1P10072 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HKR1P10072 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HKR1P10072 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HKR1P10072 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HKR1P10072 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HKR1P10072 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HKR1P10072 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HKR1P10072 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HKR1P10072 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HKR1P10072 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HKR1P10072 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HKR1P10072 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HKR1P10072 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HKR1P10072 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HKR1P10072 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HKR1P10072 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HKR1P10072 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HKR1P10072 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HKR1P10072 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HKR1P10072 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HKR1P10072 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HKR1P10072 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HKR1P10072 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HKR1P10072 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HKR1P10072 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HKR1P10072 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HKR1P10072 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HKR1P10072 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HKR1P10072 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HKR1P10072 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HKR1P10072 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HKR1P10072 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HKR1P10072 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HKR1P10072 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HKR1P10072 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HKR1P10072 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HKR1P10072 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HKR1P10072 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HKR1P10072 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HKR1P10072 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HKR1P10072 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HKR1P10072 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HKR1P10072 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HKR1P10072 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HKR1P10072 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HKR1P10072 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms