Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD3P0DMS9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD3P0DMS9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms