Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PNMA6AP0CW24 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNMA6AP0CW24 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms