Protein–RNA interactions for Protein: P0C2L3

FAM163B, Protein FAM163B, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM163BP0C2L3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM163BP0C2L3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM163BP0C2L3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms