Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VIL1P09327 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VIL1P09327 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VIL1P09327 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VIL1P09327 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VIL1P09327 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VIL1P09327 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VIL1P09327 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VIL1P09327 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VIL1P09327 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VIL1P09327 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VIL1P09327 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VIL1P09327 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VIL1P09327 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VIL1P09327 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VIL1P09327 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VIL1P09327 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VIL1P09327 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VIL1P09327 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VIL1P09327 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VIL1P09327 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VIL1P09327 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VIL1P09327 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VIL1P09327 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VIL1P09327 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VIL1P09327 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VIL1P09327 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VIL1P09327 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VIL1P09327 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VIL1P09327 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VIL1P09327 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VIL1P09327 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VIL1P09327 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VIL1P09327 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VIL1P09327 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VIL1P09327 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VIL1P09327 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VIL1P09327 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VIL1P09327 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VIL1P09327 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VIL1P09327 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VIL1P09327 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VIL1P09327 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VIL1P09327 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VIL1P09327 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VIL1P09327 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VIL1P09327 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VIL1P09327 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VIL1P09327 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VIL1P09327 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VIL1P09327 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIL1P09327 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIL1P09327 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIL1P09327 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIL1P09327 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIL1P09327 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIL1P09327 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIL1P09327 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIL1P09327 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIL1P09327 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIL1P09327 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIL1P09327 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIL1P09327 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VIL1P09327 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VIL1P09327 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VIL1P09327 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VIL1P09327 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VIL1P09327 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VIL1P09327 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VIL1P09327 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VIL1P09327 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VIL1P09327 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VIL1P09327 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VIL1P09327 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VIL1P09327 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VIL1P09327 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VIL1P09327 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VIL1P09327 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VIL1P09327 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VIL1P09327 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VIL1P09327 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VIL1P09327 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VIL1P09327 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VIL1P09327 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VIL1P09327 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VIL1P09327 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VIL1P09327 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VIL1P09327 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VIL1P09327 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VIL1P09327 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VIL1P09327 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VIL1P09327 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VIL1P09327 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
VIL1P09327 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VIL1P09327 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VIL1P09327 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VIL1P09327 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VIL1P09327 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VIL1P09327 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
VIL1P09327 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms