Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPRCP08575 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRCP08575 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRCP08575 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
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