Protein–RNA interactions for Protein: P08237

PFKM, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKMP08237 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKMP08237 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKMP08237 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKMP08237 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKMP08237 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKMP08237 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKMP08237 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKMP08237 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKMP08237 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKMP08237 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKMP08237 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PFKMP08237 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PFKMP08237 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PFKMP08237 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PFKMP08237 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PFKMP08237 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PFKMP08237 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKMP08237 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKMP08237 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKMP08237 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKMP08237 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKMP08237 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKMP08237 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKMP08237 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKMP08237 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKMP08237 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKMP08237 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKMP08237 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PFKMP08237 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKMP08237 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKMP08237 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKMP08237 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKMP08237 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKMP08237 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKMP08237 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKMP08237 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKMP08237 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKMP08237 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKMP08237 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKMP08237 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKMP08237 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKMP08237 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKMP08237 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKMP08237 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKMP08237 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKMP08237 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKMP08237 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKMP08237 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PFKMP08237 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKMP08237 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKMP08237 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKMP08237 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKMP08237 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKMP08237 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKMP08237 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKMP08237 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKMP08237 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKMP08237 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKMP08237 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKMP08237 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKMP08237 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKMP08237 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PFKMP08237 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKMP08237 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKMP08237 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKMP08237 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKMP08237 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKMP08237 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKMP08237 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKMP08237 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKMP08237 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKMP08237 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKMP08237 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKMP08237 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKMP08237 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKMP08237 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKMP08237 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKMP08237 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKMP08237 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKMP08237 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKMP08237 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PFKMP08237 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKMP08237 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKMP08237 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKMP08237 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKMP08237 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKMP08237 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKMP08237 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKMP08237 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKMP08237 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKMP08237 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKMP08237 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKMP08237 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKMP08237 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKMP08237 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKMP08237 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKMP08237 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PFKMP08237 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKMP08237 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PFKMP08237 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms