Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9P02748 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9P02748 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9P02748 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9P02748 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9P02748 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9P02748 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9P02748 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9P02748 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9P02748 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9P02748 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C9P02748 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9P02748 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9P02748 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9P02748 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9P02748 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9P02748 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9P02748 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9P02748 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9P02748 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9P02748 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9P02748 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9P02748 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9P02748 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9P02748 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C9P02748 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C9P02748 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9P02748 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9P02748 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9P02748 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9P02748 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9P02748 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9P02748 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9P02748 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9P02748 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C9P02748 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9P02748 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9P02748 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9P02748 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9P02748 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C9P02748 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C9P02748 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9P02748 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C9P02748 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9P02748 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9P02748 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9P02748 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9P02748 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9P02748 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9P02748 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms