Protein–RNA interactions for Protein: P00338

LDHA, L-lactate dehydrogenase A chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHAP00338 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDHAP00338 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDHAP00338 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDHAP00338 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDHAP00338 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDHAP00338 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDHAP00338 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDHAP00338 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDHAP00338 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDHAP00338 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDHAP00338 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDHAP00338 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDHAP00338 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDHAP00338 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDHAP00338 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDHAP00338 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDHAP00338 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LDHAP00338 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDHAP00338 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDHAP00338 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDHAP00338 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDHAP00338 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDHAP00338 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDHAP00338 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LDHAP00338 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDHAP00338 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDHAP00338 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDHAP00338 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDHAP00338 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDHAP00338 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LDHAP00338 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LDHAP00338 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDHAP00338 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDHAP00338 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDHAP00338 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDHAP00338 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDHAP00338 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDHAP00338 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDHAP00338 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LDHAP00338 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDHAP00338 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDHAP00338 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDHAP00338 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDHAP00338 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHAP00338 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHAP00338 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHAP00338 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHAP00338 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHAP00338 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHAP00338 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHAP00338 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHAP00338 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHAP00338 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHAP00338 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHAP00338 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHAP00338 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHAP00338 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHAP00338 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDHAP00338 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHAP00338 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHAP00338 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHAP00338 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHAP00338 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHAP00338 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHAP00338 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHAP00338 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHAP00338 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHAP00338 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHAP00338 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHAP00338 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHAP00338 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHAP00338 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHAP00338 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHAP00338 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHAP00338 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHAP00338 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHAP00338 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHAP00338 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHAP00338 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHAP00338 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHAP00338 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDHAP00338 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LDHAP00338 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LDHAP00338 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LDHAP00338 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LDHAP00338 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHAP00338 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHAP00338 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHAP00338 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHAP00338 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHAP00338 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHAP00338 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHAP00338 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHAP00338 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHAP00338 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHAP00338 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHAP00338 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHAP00338 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHAP00338 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDHAP00338 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms