Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
ZBED1O96006 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZBED1O96006 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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