Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABCB11O95342 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABCB11O95342 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms