Protein–RNA interactions for Protein: O76090

BEST1, Bestrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST1O76090 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEST1O76090 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEST1O76090 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEST1O76090 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEST1O76090 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEST1O76090 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEST1O76090 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST1O76090 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST1O76090 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST1O76090 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST1O76090 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST1O76090 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST1O76090 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST1O76090 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST1O76090 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST1O76090 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST1O76090 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEST1O76090 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST1O76090 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST1O76090 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST1O76090 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST1O76090 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST1O76090 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST1O76090 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST1O76090 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST1O76090 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST1O76090 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST1O76090 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST1O76090 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST1O76090 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST1O76090 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST1O76090 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST1O76090 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST1O76090 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST1O76090 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST1O76090 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEST1O76090 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST1O76090 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST1O76090 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST1O76090 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST1O76090 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST1O76090 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST1O76090 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST1O76090 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST1O76090 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST1O76090 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEST1O76090 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST1O76090 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST1O76090 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST1O76090 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST1O76090 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST1O76090 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST1O76090 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST1O76090 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST1O76090 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST1O76090 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST1O76090 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST1O76090 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST1O76090 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST1O76090 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BEST1O76090 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
BEST1O76090 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BEST1O76090 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BEST1O76090 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BEST1O76090 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BEST1O76090 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BEST1O76090 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BEST1O76090 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST1O76090 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST1O76090 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST1O76090 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST1O76090 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST1O76090 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST1O76090 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST1O76090 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST1O76090 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST1O76090 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST1O76090 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST1O76090 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST1O76090 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST1O76090 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST1O76090 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST1O76090 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST1O76090 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BEST1O76090 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST1O76090 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST1O76090 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST1O76090 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST1O76090 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST1O76090 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST1O76090 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST1O76090 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST1O76090 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST1O76090 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST1O76090 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST1O76090 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST1O76090 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST1O76090 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST1O76090 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BEST1O76090 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms